昌吉司法认定程序合法性，包括司法认定的提请、决定与委托、受理、实施、补充鉴定、重新鉴定、专家共同鉴定等各个环节上必须符合诉讼法和其他相关法律法规和部门规章的规定。昌吉司法认定的步骤、方法应当是经过法律确认的、有效的，鉴定标准要符合国家法定标准或部门（行业）标准。新疆司法鉴定结果的合法性，主要表现为司法认定文书的合法性。鉴定文书必须具备法律规定的文书格式和必备的各项内容，鉴定结论必须符合证据要求和法律规范。

新疆司法受理业务是司法鉴定的第一关。作为新疆司法鉴定机构负责人，要规范标准，严格管理；作为具体受检的工作人员，要规范程序，细致周密。否则是非不断，后患无穷。新疆司法鉴定机构应当统一受理司法鉴定的委托《司法认定程序通则》第二章第十一条明确规定，“司法认定中心应当统一受理司法鉴定的委托。”《全国人民代表大会常务委员会关于司法鉴定管理问题的决定》第九条明确规定，“鉴定人从事司法鉴定业务，由所在的鉴定机构统一接受委托”。如果昌吉司法认定中心或者诉讼当事人希望确定由某个鉴定人提供鉴定意见的，也必须通过该鉴定人所在的鉴定机构办理委托手续。鉴定人不得私自接受司法鉴定。

昌吉司法认定受理业务鉴定结论时一定要把好种类关: 从理论上讲，鉴定意见应当是确定性的。要么肯定，要么否定。但在司法鉴定实践中，确实因检材和样本数量、质量等客观原因的限制不能做出确定性意见，但司法实践需要，鉴定人可根据检材和样本的客观情况，运用所掌握的专业知识和积累的实践经验，对鉴定内容作出推断性意见。昌吉司法认定受理业务鉴定结论时确定性意见: 肯定同一。该鉴定意见是笔迹鉴定中明确的认定意见。通常表述为“检材字迹是某人所写的。”否定同一。该鉴定意见是笔迹鉴定中明确的否定意见，通常表述为“检材字迹不是某人所写。

昌吉司法认定，是指在诉讼过程中，对案件中的专门性问题，由司法机关或当事人委托法定鉴定单位，运用专业知识和技术，依照法定程序作出鉴别和判断的一种活动。虽然昌吉司法认定行业发展迅速，但在发展过程中遇到了多头鉴定、重复鉴定、屡鉴不定等问题，严重影响了行业的发展。司法鉴定的法律规定分散于三大诉讼法中，且缺乏可操作性，建议制定司法认定管理法。同时，对三个诉讼法相关规定进行修改，切实解决多头鉴定、重复鉴定、屡鉴不定的问题。

司法认定是指依法取得有关司法认定资格的鉴定机构和鉴定人受司法机关或当事人委托，运用建筑学理论和技术，对与建筑工程相关的问题进行鉴定并提供鉴定结论的活动，其主要内容包括：建筑工程质量评定、工程质量事故鉴定、工程造价纠纷鉴定等。新疆司法认定枪弹痕迹：枪弹痕迹，包括弹头、弹壳、弹孔、着弹点、附着物及枪支发射后的特有痕迹。根据弹痕和火药痕迹可以判断射击的距离和方向。根据弹头、弹壳痕迹可以判断枪支种类和认定发射的枪支。根据射击痕迹、弹头、弹壳分布的位置，可以判断罪犯在作案现场的活动情况。

昌吉司法认定人必须是具备规定的条件，获得司法认定人职业资格的执业许可证的自然人。昌吉司法认定材料主要是指鉴定对象及其作为被比较的样本（样品）。鉴定对象必须是法律规定的案件中的专门性问题，法律未作规定的专门性问题不能 作为司法鉴定对象。如我国现阶段对司法心理测定（俗称测谎）、气味鉴别（警犬鉴定）等尚未作为法定鉴定对象，其鉴定结论不能作为证据。而且鉴定材料的来源 （含提取、保存、运送、监督等）必须符合相关法律规定的要求。